在陡峭的山谷腹地，勇敢无畏的口袋妖怪凯路迪欧(由中川寿子配音)跟随传奇剑士克巴卢(由山寺一郎配音)、泰利欧(由安元洋贵配音)和比利基恩(由本田贵子配音)练习并继续朝着剑士的目标努力。不自量力的凯路迪欧不听三位老师的建议，贸然挑战龙中最强的神奇宝贝酋雷姆(高桥克实)。只有当他们相遇时，他们才意识到他们远非酋雷姆的对手。在关键时刻，三位圣剑士出现了，他们愿意牺牲自己来拯救他们的弟子。伤痕累累的凯路迪欧在一次游学中偶然遇到了小芝(松本梨香配音)、天桐(宫野真守配音)和爱丽丝(悠木碧配音)。愤怒的酋雷姆紧随其后。一场新的战斗事故开始了...这部电影是为了纪念初中成立90周年。